急性肾盂肾炎需和下列疾病区别：急性肾盂肾炎和急性膀胱炎的区别，在于急性膀胱炎时病人无发热，全身状态良好，疼痛不在腰部而在下腹部；急性肾盂肾炎与肾皮质化脓性感染和肾周围炎的区别，在于后两种情况虽都有全身症状和肾区肿胀或疼痛，但无膀胱刺激症状，尿中也不含脓细胞，肾周围炎或脓肿可出现患侧髋关节屈曲；胰腺炎引起的腰部疼痛可与急性肾盂肾炎混淆，但胰腺炎病人血清淀粉酶升高，尿中不含脓细胞；肺底部肺炎刺激胸膜引起肋缘下疼痛，与急性肾盂肾炎的区别可予以胸部透视明确诊断；急性肾盂肾炎和急性阑尾炎、急性胆囊炎的区别，在于后二者疼痛在腹部，伴有右上或右下腹部肌肉紧张和反跳痛，尿中无脓细胞。