东配殿在隆恩殿东厢，歇山式、顶铺黄色琉璃瓦，，四面出廊，面阔共三间，宽18米，进深二间，共7.9米。其下有低矮的石基座，门窗梁柱朱漆彩绘，殿内原有小暖间及宝座等一些陈设。东配殿有两项重要用途。

一、存祝版和制帛——每当大祭前一天，盛京礼部要将制板、制帛等物送来福陵，这两件祭物极为重要。它们是皇帝向先帝、先后表达哀思和愿望的文书，祝板和祝帛送到福陵，暂时存于东配殿，第二天凌晨，盛京礼都读祝官和赞礼郎等人到此向祝版、祝帛行一跪四叩头礼，将祝帛请至陛恩殿祭扫。

二、存放神牌——每当隆恩殿大修时，要将殿内供奉的太祖、孝慈高皇后两座神牌由隆恩殿情至东配殿暂时供奉，等待隆恩殿竣工之后重新将神牌请回。恭请神牌是福陵一种大礼，皇帝要钦派宗室或盛京将军主持，其它人无资格随便请神牌、如，乾隆三十年五月隆恩殿大修，高宗钦命宗室公永玮、都统四格会同盛京将军舍图肯将种牌移到东配殿。高宗要求永玮在盛京等候，工程完竣将种牌重新请回隆恩殿方允永玮回京交差。还有，神牌在东配殿供奉期间，所有大祭、小祭及其它祭扫一律在东配股按制举行，所以说，东配殿在陵寝中的地位仅次于隆恩殿。

西配殿在隆恩殿西厢，共五间，建筑样式与东配殿相同经实测：面阔18米，进深7，95米。

此殿是太祖“忌辰”（八月十一日）大祭，孝慈高皇后“忌辰”（九月二十七日）大祭时，喇嘛们诵经作法超度亡灵的“道场”，殿内原设有：“唐卡”、条桌、坐俱等陈设。除此之外，未见此殿做其它使用。